船舶管理是游戏核心玩法之一，涉及舰船研究、建造、编组、维护及战术配置等多个环节。科研基地是舰船研究的起点，需投入金属、稀有元素等资源启动研究流程，研究时间固定但可通过增派科研团队缩短周期。舰船蓝图研究完成后，可选择在造船厂建造或通过市场交易，同时已拥有舰船可通过研究系统进行升级改造。资源分配需优先保障科研需求，避免因短缺导致研究中断，特殊事件和任务可能提供额外研究加成。
船舶建造需基于蓝图和资源储备，不同类型舰船消耗差异显著。工程船作为资源采集核心单位，建议优先建造大型工程船以确保采矿效率，同时根据发展阶段调整工程船与战斗舰船的比例。战斗舰船分为护卫艇、驱逐舰、巡洋舰等多类，每类又有功能子型号，需根据战术需求选择建造。例如装甲型舰船适合前排防御，多功能型舰船则侧重中排输出。建造队列需合理安排优先级，避免因过度集中导致资源链断裂或防御真空。
舰队编组需综合考虑舰船站位、火力类型与指挥值消耗。护卫艇和驱逐舰适合前期编队，巡洋舰及以上舰船受地形限制需谨慎部署。编组时可依据对舰火力、防空火力和巡航速度等数据分类，针对星系作战、基地防御等不同场景定制舰队。受损舰船停泊基地后自动维修，但战况紧急时可选择退役并重建以节省时间。前哨站对接功能可节省计划槽位，通过与矿物或中立建筑对接获取资源加成或特殊效果，例如矿业采集站能提升10%采矿效率。
舰船强化与技术优化是持续性的管理重点。通过蓝图研究获取技术值后，需针对性强化舰船属性：前排舰船优先提升护甲与能量抗性，后排舰船侧重伤害与命中率。武器系统存在克制关系，例如能量武器能有效穿透护甲。工程船通过采矿积累经验后，应优先强化采集技能。舰载装备需定期更新，稀有装备对战力提升显著。加入活跃同盟可获取协同作战优势，通过联合防御或资源互助降低管理压力。
战术层面的船舶管理需注重动态调整。侦查型舰船应全动力加点以保障机动性，奶船需强化治疗效率而非输出。不同舰船攻击序列存在差异，需通过实战测试优化配置。高价值舰船如航母需避免孤军深入，利用地形规避小型舰船围攻。工程船执行任务时需规划安全航线，必要时联合盟友建立星际基地作为防御支点。资源点采集需监控储量，及时轮换工程船以避免效率衰减。
长期管理策略强调资源与科研的平衡发展。金属和晶体是初期关键资源，需通过城建与工程船双渠道保障供给。技术研发应同步推进舰船性能与采集效率，避免出现战斗舰船先进但资源跟不上的情况。市场交易可作为资源调配的补充手段，用富余蓝图换取紧缺材料。定期评估舰队整体结构，淘汰低效舰船并为新蓝图预留建造空间，保持舰队在探索、采集、战斗等多场景下的适应能力。
